肺炎链球菌的主要传播途径是通过呼吸道飞沫传播。当感染者咳嗽、打喷嚏或说话时，会释放含有病菌的微小液滴，这些液滴可以被周围的人吸入，从而导致感染。此外，肺炎链球菌也可以通过直接接触感染者的鼻咽分泌物而传播。在人群密集的地方如学校、托儿所和养老院等地方更容易发生这种细菌的传播。
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