在显微镜下观察细菌，首先需要制备好可以清晰看到细菌的样本。具体步骤如下：
1. 制片：取少量待检材料（如血液、体液、分泌物等），用无菌操作方法将其涂布或滴加到干净的载玻片上形成一层薄膜。
2. 固定：将制好的涂片置于酒精灯火焰上方快速来回移动几次，或者使用化学固定剂（如甲醇）处理，使细菌细胞与载玻片紧密结合，并杀死部分细菌以防止其移动。这一步是为了让细菌更加牢固地粘附在载玻片上。
3. 染色：染色是提高对比度、便于观察的重要步骤。常用的染色方法有革兰氏染色法和抗酸染色法等。通过不同的染色技术可以区分不同类型的细菌，如革兰阳性菌与革兰阴性菌的差异。
4. 封片：使用中性树胶等物质将盖玻片覆盖在已染色的样本上，并轻轻按压使其贴合均匀。
5. 观察：将制好的标本放置于显微镜载物台上，调整光源亮度及焦距直至视野清晰。先用低倍镜找到合适的观察区域，再转换至高倍镜或油浸镜头进行详细观察。注意调节细调旋钮使图像达到最佳清晰度。
6. 记录：记录下所见的细菌形态、排列方式及其染色特性等信息，以便于后续分析和诊断。

在操作过程中要注意安全卫生规范，避免污染样本及自身感染风险。