红细胞膜缺陷主要会影响一些关键的结构蛋白和功能蛋白，这些蛋白对于维持红细胞正常的形态、稳定性和变形能力至关重要。其中最重要的包括：
1. 带3蛋白（Band 3 protein）：这是红细胞膜上含量最丰富的蛋白质之一，它在阴离子交换中起着重要作用，并且与细胞骨架蛋白相互作用，对保持红细胞的正常形状和功能有重要影响。
2. 骨架蛋白4.1 (Protein 4.1)：这种蛋白质负责将带3蛋白等跨膜蛋白连接到细胞内的肌动蛋白纤维上，对于维持红细胞膜的结构稳定性和完整性至关重要。
3. 肌动蛋白（Actin）和肌球蛋白（Myosin）：作为细胞骨架的主要成分，它们参与了红细胞形状的变化及通过血管时所需的变形能力。
4. 锚蛋白（Ankyrin）：它是一种连接带3蛋白与细胞内骨架系统的桥梁分子，对于保持膜的稳定性和流动性非常重要。
5. 血影蛋白（Spectrin）：这是一种长链蛋白质，构成了红细胞内部的主要支架结构。血影蛋白通过与其他多种蛋白如锚蛋白、4.1蛋白等相互作用来维持红细胞的双凹盘状形态和弹性。

当上述任何一种或几种蛋白质出现缺陷时，都可能导致红细胞膜功能障碍，进而引发一系列疾病，例如遗传性球形红细胞增多症（Hereditary Spherocytosis, HS）、椭圆形红细胞增多症（Hereditary Elliptocytosis, HE）等。