在显微镜下观察细菌，可以发现它们具有多种形态特征。这些特征对于细菌的分类和鉴定非常重要。主要的形态特征包括：
1. 形状：细菌最常见的形状有球形（如葡萄球菌）、杆形（如大肠杆菌）和螺旋形（如螺旋体）。根据其具体形状，还可以进一步细分为链球菌、双球菌等。
2. 大小：不同种类的细菌大小不一。一般来说，大多数细菌的直径在0.5到5微米之间，但也有例外。例如，某些放线菌可以达到几十甚至上百微米长。
3. 排列方式：同一种类的细菌可能以不同的方式排列在一起，比如成对出现（双球菌）、链状排列（链球菌）或葡萄串状聚集（葡萄球菌）等。
4. 鞭毛与菌毛：有些细菌表面具有细长的鞭毛用于运动，或者较短的菌毛用于黏附宿主细胞。这些结构在特定染色后可在显微镜下观察到。
5. 荚膜和芽孢：部分细菌会产生一层透明的荚膜作为保护层，或是在不利环境下形成耐热、抗干燥的休眠体——芽孢。这些特殊构造同样可以通过特殊的染色技术来识别。

了解并掌握上述形态特征对于进行准确的微生物检验至关重要。在实际操作中，结合培养特性及生化反应等其他方法可以更全面地鉴定细菌种类。