常用的细菌分离培养基主要有四大类，分别是基础培养基、营养培养基、选择性培养基和鉴别培养基。
1. 基础培养基：这类培养基是最简单的培养基，主要由蛋白胨、牛肉膏、氯化钠以及琼脂等基本成分组成。例如肉汤培养基和平板计数琼脂（PCA），它们可以满足大多数细菌生长的基本需求但不提供额外的营养或选择性功能。
2. 营养培养基：在基础培养基的基础上添加了血清、血液、酵母提取物或其他富含有机物质以促进某些特定类型细菌的生长。例如，血琼脂平板（BAP）就是一种常用的营养培养基，它能支持许多苛求菌和病原体的生长，并且可以观察到溶血现象。
3. 选择性培养基：设计用于抑制非目标微生物的同时允许目标微生物生长。通过加入抗生素、染料或其他化学物质来实现这一目的。例如，麦康凯琼脂（MAC）用于分离肠道革兰氏阴性杆菌；SS琼脂则用于沙门氏菌和志贺氏菌的筛选。
4. 鉴别培养基：这类培养基含有特定的指示剂或底物，能够根据细菌代谢产物的不同颜色变化来区分不同的菌种。例如，伊红美蓝（EMB）琼脂可用于区分乳糖发酵与非发酵的大肠杆菌群落；尿素琼脂则用来检测尿素酶阳性的微生物。

每一种培养基都有其特定的应用场景和优势，在实际操作中应根据待分离细菌的特性选择合适的培养基。