衣原体是一类专性细胞内寄生的微生物，因此其培养具有一定的难度。主要难点包括：
1. 衣原体需要活细胞才能生长繁殖：因为它们缺乏合成基本生物分子的能力，所以必须在宿主细胞中进行培养，这与细菌等其他微生物可以在人工培养基上生长的情况不同。
2. 特定的细胞系需求：不同的衣原体种类可能需要特定类型的细胞来支持其生长。例如，肺炎衣原体通常使用HEp-2或 McCoy 细胞系，而沙眼衣原体则常采用HeLa 229 或 L929 细胞。
3. 感染效率低：即使是在适宜的细胞环境中，衣原体的感染率也可能较低，这增加了检测和分离的难度。
4. 培养时间较长：与许多其他病原体相比，衣原体的生长周期较长，从接种到观察到明显的细胞病变效应（CPE）通常需要几天甚至几周的时间。
5. 污染风险高：由于培养过程中需要用到活细胞，因此存在被其他微生物污染的风险。任何外来污染物都可能干扰实验结果或导致失败。
6. 技术要求较高：衣原体的分离和鉴定过程较为复杂，对操作人员的技术水平有较高的要求，需要具备良好的无菌技术和显微镜观察技能等。

综上所述，衣原体培养不仅耗时长、成本高，而且技术难度大，在实际应用中需谨慎处理。