肠杆菌科是一大类革兰氏阴性杆菌，包括许多重要的病原体。在临床上，正确地鉴定这些细菌对于选择合适的治疗方法至关重要。区分肠杆菌科不同菌属的方法主要包括生化特性、血清学试验和分子生物学方法。
1. 生化特性：这是最常用也是最基本的鉴别手段。通过一系列的生化反应测试（如发酵葡萄糖、乳糖等碳源的能力，产生硫化氢的能力，尿素酶活性，吲哚生成能力，动力实验等），可以初步区分不同的菌属。例如，大肠埃希氏菌能够发酵乳糖产酸产气，而沙门氏菌则不能。
2. 血清学试验：利用特定的血清型抗体来识别和分组细菌。每个菌种都有其独特的抗原结构，通过与相应的单克隆或多克隆抗体反应可以实现特异性鉴定。比如O抗原、H抗原等都是重要的分类依据。
3. 分子生物学方法：随着分子技术的发展，基于DNA序列分析的方法越来越受到重视。例如16S rRNA基因测序、多位点序列分型（MLST）和全基因组测序等可以提供更为准确的菌种信息。这些方法不仅能够确定到种甚至株水平，还能揭示细菌间的亲缘关系。

在实际操作中，通常会结合以上几种方法来进行综合判断。首先通过生化特性进行初步筛选，然后根据需要选择血清学试验或分子生物学技术进一步确认。每一步的测试结果都需要仔细分析，并与已知的标准数据比对，以确保最终鉴定结果的准确性。