在临床微生物学实验室中，鉴别肠球菌与其它革兰阳性球菌主要依赖于一系列生化反应和培养特性。以下是常用的几种方法：
1. 革兰染色：首先通过革兰染色确定细菌为革兰阳性球菌。肠球菌通常排列成对或短链。
2. 培养特征：肠球菌在血平板上生长良好，可形成灰白色、圆形、光滑的菌落，有时可见轻微溶血环。在麦康凯琼脂（MacConkey agar）上也能生长，但不会产生明显的红色色素。
3. 胆汁七叶苷水解试验：肠球菌能分解胆盐和七叶苷产生黄色产物，此反应阳性可作为初步筛选依据之一。
4. 6.5%NaCl耐受性测试：大多数肠球菌能够在含有6.5%氯化钠的培养基中生长，而许多其他革兰阳性球菌则不能。
5. 高浓度利福平敏感性试验：部分种类如粪肠球菌对高浓度（400μg/mL）利福平保持高度敏感，可用于辅助鉴定。
6. 药敏试验：根据药敏结果分析也可以帮助区分不同类型的革兰阳性球菌。例如，肠球菌通常对抗生素如青霉素、氨苄西林等具有特定的敏感性和耐药模式。
7. 分子生物学方法：如果常规生化反应难以确定，则可以采用PCR技术检测特异性基因序列以明确鉴定到种水平。

通过上述一系列实验步骤，实验室工作人员能够准确地区分肠球菌与其他革兰阳性球菌。