在进行志贺菌感染的鉴别诊断时，主要依据病人的临床表现、流行病学资料以及实验室检查结果来进行。具体步骤如下：
1. 了解患者的基本情况和流行病学史：询问患者是否有不洁饮食史或与已知感染者有接触的历史，因为志贺菌是一种通过粪-口途径传播的细菌，常见于卫生条件较差地区的人群中。
2. 观察临床症状：典型的表现包括急性腹泻（可能伴有脓血便）、腹痛、发热等。严重病例可能出现脱水、电解质失衡等情况。
3. 实验室检查：
   - 大便常规检查：可见大量白细胞和红细胞。
   - 细菌培养：取粪便样本进行细菌分离培养，使用选择性培养基如SS琼脂或麦康凯平板等可以有效提高阳性率。若从标本中分离出志贺菌，则可确诊为志贺菌感染。
   - 分子生物学检测：如PCR技术可以直接针对特异性基因序列进行扩增，具有较高的敏感性和特异性。

4. 鉴别诊断：
   - 与其他细菌性肠炎相区分，例如沙门氏菌、弯曲杆菌等引起的急性胃肠炎；
   - 与病毒性腹泻（轮状病毒、诺如病毒等）和寄生虫感染（阿米巴病）进行鉴别。
   - 考虑患者是否服用过抗生素，因为某些情况下可能会导致伪膜性肠炎。

通过上述方法综合分析后，可以较为准确地诊断志贺菌感染，并为后续治疗提供依据。