蛋白C系统在体内是一个重要的天然抗凝机制，主要通过抑制凝血酶原激活和纤维蛋白形成来发挥其抗凝作用。这个系统的成分主要包括蛋白C、蛋白S以及凝血酶调节蛋白（也称为内皮细胞蛋白C受体，EPCR）。当血液中的凝血过程被启动时，蛋白C系统便开始发挥作用。
1. 蛋白C的活化：在血管内皮细胞表面存在的凝血酶调节蛋白的帮助下，凝血酶可以将蛋白C转化为活性形式——活化的蛋白C（APC）。
2. 抑制因子V和因子VIII：一旦被激活，APC能够与蛋白S结合，形成复合物。这个复合物主要通过灭活凝血过程中的关键辅因子——因子Va和因子VIIIa来抑制血液的进一步凝固。因子Va是凝血酶原转化为凝血酶的关键辅助分子，而因子VIIIa则参与了凝血酶生成的过程。
3. 促进纤溶：除了直接抗凝作用外，蛋白C系统还通过间接机制促进了纤维蛋白的溶解。例如，活化的蛋白C能够增加组织型纤溶酶原激活剂（tPA）的活性，从而加速纤维蛋白的分解过程。

总之，蛋白C系统通过上述方式有效地调节了体内凝血与抗凝之间的平衡，防止不正常的血液凝固发生，对维持血液循环系统的正常功能具有重要意义。在临床应用中，对于一些由于蛋白C或蛋白S缺乏导致的易栓症患者，可以通过补充相应的蛋白质来改善症状。