实验室确诊沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis）感染主要依赖于直接检测病原体或其核酸，以及间接检测宿主对病原体的免疫反应。目前常用的确诊方法包括：
1. 核酸扩增试验（NATs）：这是目前最常用的诊断手段之一，尤其是聚合酶链式反应（PCR）。此技术可以从尿液、宫颈拭子、尿道拭子等样本中直接检测沙眼衣原体的DNA。因为其高度敏感性和特异性，被认为是金标准。
2. 抗原检测：通过快速抗原检测试剂盒来检测样本中的沙眼衣原体特定抗原，如MOMP（主要外膜蛋白）。这种方法操作简便快捷，但灵敏度和特异度相对较低，可能会漏诊部分病例。
3. 细胞培养法：虽然被认为是诊断的金标准之一，但由于技术要求高、耗时长且成本较高，在常规临床实践中较少使用。细胞培养可以观察到沙眼衣原体在宿主细胞内的生长情况，并进一步通过免疫荧光染色等方法确认。
4. 血清学检测：主要用于流行病学调查或回顾性诊断，通过测定患者血清中特异性抗体水平变化来判断是否感染过沙眼衣原体。然而，在急性期单次血清样本难以明确当前是否存在活动性感染，需要结合临床症状和其他检查结果综合分析。

在实际应用中，通常会根据实验室条件、检测目的及患者具体情况选择合适的检测方法。对于疑似病例，建议首先采用NATs进行筛查；若需进一步验证或研究，则可考虑使用其他辅助手段。