脂质转运蛋白在体内的主要功能是调节和运输脂质，确保细胞内外脂质的平衡。它们的作用机制主要包括以下几个方面：
1. 脂质结合：脂质转运蛋白能够特异性地识别并结合游离脂肪酸、胆固醇等脂质分子。这种结合不仅保护了脂质免受氧化损伤，也增加了其在水相中的溶解度，便于运输。
2. 细胞膜上的受体介导的摄取与释放：当载脂蛋白携带的脂颗粒到达目标细胞时，会通过细胞表面特定的受体进行识别。一旦结合成功，就可以启动内吞过程或直接将脂质传递给细胞内的其他分子，完成物质交换。
3. 调控脂代谢相关酶活性：某些脂质转运蛋白还能够调节参与脂类合成、分解及转化的各种关键酶的活性，从而影响整体的脂质代谢水平。例如，ApoCIII可以抑制脂蛋白脂肪酶（LPL）的作用，减缓甘油三酯水解的速度；而ApoA1则能激活卵磷脂-胆固醇酰基转移酶（LCAT），促进血浆中游离胆固醇向成熟形式转化。
4. 信号传导作用：部分脂质转运蛋白除了直接参与脂质运输外，还可能作为信号分子参与到细胞内外的信号传递过程中。它们可以影响基因表达、细胞增殖分化等生理过程。

总之，脂质转运蛋白通过上述多种方式，在维持机体正常生理功能中发挥着重要作用，并且与动脉粥样硬化等多种疾病的发生发展密切相关。