在实验室中鉴定志贺菌通常需要经过一系列步骤，包括细菌培养、生化试验和分子生物学方法。以下是具体的流程：
1. 样本采集：首先从疑似患者处采集合适的临床样本，如粪便或直肠拭子。
2. 前处理与增菌：将采集到的标本接种于选择性培养基（例如SS琼脂、麦康凯琼脂等）上进行前处理和增菌。这些培养基能够抑制非目标微生物生长的同时促进志贺菌的繁殖。
3. 初步筛选：观察平板上的菌落形态，志贺菌通常形成无色透明或半透明的小菌落。然后挑取疑似菌落做进一步鉴定。
4. 生化特性测试：
- 发酵葡萄糖产酸不产气
- 不分解乳糖、蔗糖和麦芽糖
- 硫化氢阴性
- 尿素酶试验阴性
- 靛基质（Indole）试验阳性或阴性
5. 血清学鉴定：使用多价抗血清进行玻片凝集实验，以确定是否为志贺菌属。如果出现凝集反应，则说明该菌株可能是志贺菌。
6. 分型与毒力基因检测：
- 利用PCR技术扩增特定的毒力相关基因（如ipaH、set1A等）来区分不同的血清型及确认其致病性。
- 通过测序分析获得更准确的信息。
7. 药敏试验：对于临床分离株还需进行药敏测试，了解其对抗生素敏感情况，指导临床治疗。
整个过程需要严格遵守实验室安全操作规程，并由具备相应资质的专业人员完成。
