毛细胞白血病（Hairy Cell Leukemia, HCL）的确诊除了依赖于血液学和骨髓检查外，还需要进行一些特定的分子生物学检测以辅助诊断。常用的分子检测包括：
1. 基因突变分析：约95%以上的HCL患者存在BRAF V600E基因突变，这是目前最特异性的分子标志物之一。因此，对于疑似病例应常规进行BRAF V600E突变的检测。
2. 免疫表型分析：虽然不是严格意义上的“分子”检测，但流式细胞术可以用来确定特定的白血病相关抗原表达模式，如CD19、CD20、CD25、CD103和CD11c等阳性表达以及CD22的部分表达。这些特征有助于与其他类型的B淋巴细胞肿瘤相区分。
3. 融合基因检测：尽管在HCL中较为罕见，但在某些情况下可能需要排除其他类型的白血病或淋巴瘤，如通过荧光原位杂交（FISH）技术来寻找特定的染色体异常或者融合基因的存在。
4. 高通量测序：对于部分难治性或复发性的病例，可以考虑采用全外显子组测序或靶向基因面板测序等方法进一步探索潜在的遗传学改变，以指导个体化治疗方案的选择。

综上所述，在毛细胞白血病的确诊过程中，BRAF V600E突变检测是最关键且最具特异性的分子标志物。同时结合免疫表型分析和其他可能需要的基因检测结果，可以提高诊断准确性和临床处理的有效性。