微生物检验常用的染色方法有多种，这些方法在鉴别微生物形态、结构等方面具有重要作用。

单染色法是一种简单的染色方法。它只用一种染料对细菌进行染色，如美蓝或复红染色液。这种方法操作简便，能使细菌着色，从而在显微镜下更清晰地观察细菌的形态、大小和排列方式，但不能显示细菌的特殊结构和区分细菌的种类。

革兰染色法是微生物学中最为重要的鉴别染色法之一。其操作步骤包括初染（用结晶紫染色）、媒染（用碘液）、脱色（用95%乙醇）和复染（用稀释复红）。通过革兰染色，可将细菌分为革兰阳性菌和革兰阴性菌。革兰阳性菌染成紫色，革兰阴性菌染成红色。这有助于对细菌进行初步分类，为临床诊断和治疗提供重要依据，因为不同类型细菌对药物的敏感性不同。

抗酸染色法主要用于鉴别抗酸杆菌，如结核分枝杆菌。先以石炭酸复红加温染色，再用盐酸酒精脱色，最后用美蓝复染。抗酸杆菌能抵抗盐酸酒精的脱色作用，被染成红色，而非抗酸菌则被染成蓝色。该方法对于结核病等疾病的诊断具有关键意义。

特殊染色法用于显示细菌的特殊结构。例如荚膜染色法，由于荚膜含水量高、不易着色，一般采用衬托法，使菌体和周围背景着色，而荚膜不着色，从而在菌体周围呈现一透明圈，便于观察荚膜。鞭毛染色法可使鞭毛着色，能观察到细菌鞭毛的有无、数量和着生位置，有助于细菌的鉴定。芽孢染色法利用芽孢壁厚、透性低，不易着色但一旦着色就难以脱色的特点，采用孔雀绿加热染色，再用番红复染，芽孢呈绿色，菌体呈红色，可清晰区分芽孢和菌体。

这些染色方法各有特点和用途，在微生物检验中相互配合，为准确鉴定微生物、诊断感染性疾病等发挥着重要作用。