结核分枝杆菌的致病物质主要包括以下几类。

首先是脂质，它在结核分枝杆菌的致病过程中起着关键作用。脂质中的磷脂能促使单核细胞增生，还可使病灶形成结核结节和干酪样坏死。脂肪酸中的索状因子具有破坏细胞线粒体膜、影响细胞呼吸、抑制白细胞游走和引起慢性肉芽肿的作用。蜡质D是一种肽糖脂与分枝菌酸的复合物，能激发机体产生迟发型超敏反应。硫酸脑苷脂和硫酸多酰基化海藻糖能抑制吞噬细胞中吞噬体与溶酶体的结合，使结核分枝杆菌能在吞噬细胞中长期存活。

其次是蛋白质，结核菌素是其中的主要成分。它本身无毒性，但与蜡质D结合后能使机体发生超敏反应，引起组织坏死和全身中毒症状，在结核结节的形成中发挥重要作用。

再者是多糖，常与脂质结合存在于细胞壁中。它能刺激机体产生抗体，但在致病中的具体作用还需要进一步研究，可能与免疫反应的调节等方面有关。

此外，荚膜也是结核分枝杆菌的致病物质之一。荚膜能保护细菌免受吞噬细胞的吞噬和消化，还可与吞噬细胞表面的补体受体结合，有助于细菌在吞噬细胞内的寄生，并且能抑制吞噬体与溶酶体的融合，为细菌在细胞内的生存和繁殖创造有利条件。总之，这些致病物质相互配合，使得结核分枝杆菌能够在宿主体内生存、繁殖并引发疾病。