肺炎链球菌的致病物质主要有以下几种：

首先是荚膜，这是肺炎链球菌最重要的致病物质之一。荚膜具有抗吞噬作用，它可以保护细菌免受吞噬细胞的吞噬和消化，使得细菌能够在机体内存活和繁殖。当肺炎链球菌侵入人体后，荚膜能够阻止吞噬细胞对其的识别和吞噬，从而有利于细菌在组织中大量生长，进而引发感染。如果肺炎链球菌失去荚膜，其毒力会显著下降，致病性也会大大减弱。

肺炎链球菌溶血素O也是关键致病物质。它对多种细胞具有毒性作用，能够溶解红细胞，破坏白细胞和血小板。当它作用于细胞膜时，会导致膜的通透性改变，使细胞内的物质外漏，最终引起细胞死亡。同时，它还可以影响补体的激活过程，干扰机体的免疫防御机制，从而有利于细菌在体内的生存和扩散。

神经氨酸酶同样在致病过程中发挥重要作用。它能够分解细胞膜表面的神经氨酸，破坏细胞表面的结构。这有助于肺炎链球菌在呼吸道黏膜表面的黏附与定植，使得细菌更容易侵入呼吸道上皮细胞。而且，神经氨酸酶还可以影响机体的免疫细胞功能，降低免疫细胞对细菌的清除能力。

此外，紫癜形成因子也是肺炎链球菌的致病物质。它能够引起皮肤紫癜和出血，可能是通过损伤血管内皮细胞，导致血管通透性增加，血液渗出到周围组织而形成紫癜。同时，它还可能与肺炎链球菌感染后的全身症状和并发症的发生有关。

综上所述，肺炎链球菌凭借荚膜、肺炎链球菌溶血素O、神经氨酸酶和紫癜形成因子等致病物质，对人体造成感染和损害，引发肺炎等多种疾病。