呼吸道感染微生物具有多方面特点。从种类多样性来看，引起呼吸道感染的微生物种类繁多。细菌方面，常见的有肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、
流感嗜血杆菌等。肺炎链球菌是社区获得性肺炎的重要病原菌，它具有荚膜，能抵抗吞噬细胞的吞噬作用，其致病力主要源于荚膜的侵袭作用。金黄色葡萄球菌可产生多种毒素和酶，如溶血素、血浆凝固酶等，能引起严重的化脓性感染。
流感嗜血杆菌则是儿童呼吸道感染的常见病原菌，尤其在婴幼儿中易引发肺炎、
中耳炎等疾病。
病毒也是呼吸道感染的常见病原体，像
流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒等。
流感病毒具有高度的变异性，其表面的血凝素和神经氨酸酶容易发生变异，导致新的亚型出现，使得人群普遍易感，容易引起大规模的流行。呼吸道合胞病毒是婴幼儿下呼吸道感染的主要病原体，可引起细支
气管炎和肺炎。
真菌同样可导致呼吸道感染，如念珠菌、曲霉菌等。念珠菌在人体免疫力下降时可大量繁殖，引起呼吸道黏膜的感染。曲霉菌可在呼吸道内形成菌丝，导致肺部的侵袭性感染，病情往往较为严重。
在传播途径上，呼吸道感染微生物主要通过空气飞沫传播，当患者
咳嗽、打喷嚏时，含有病原体的飞沫可在空气中悬浮，被他人吸入后引起感染。也可通过接触传播，如接触被污染的物品后再触摸口鼻等部位而感染。
此外，这些微生物的致病性还与宿主的免疫力密切相关。在免疫力正常的人群中，可能仅引起轻微的上呼吸道感染症状，如
咳嗽、流涕等；而在免疫力低下的人群，如老年人、儿童、患有慢性疾病者或使用免疫抑制剂的患者中，则可能引发严重的下呼吸道感染，甚至导致呼吸衰竭等严重后果。
