军团菌属是一类革兰氏阴性杆菌，具有一些典型的形态特点。

从大小和形状来看，军团菌为细长的杆菌，大小一般在（2 - 20）μm×（0.3 - 0.9）μm 之间。通常呈多形性，除了常见的杆状形态外，还可呈丝状，有时可见到短链状排列。这种多形性使得其在显微镜下的形态观察具有一定的复杂性。

在染色特性方面，军团菌革兰氏染色不易着色，这是其一个重要特点。这可能与其细胞壁的特殊结构有关。一般常用 Dieterle 镀银染色法或 Gimenez 染色法来进行染色观察。采用 Dieterle 镀银染色后，军团菌被染成黑褐色，在显微镜下能够较为清晰地显示其形态。而 Gimenez 染色法可将军团菌染成红色，背景为绿色，这种染色方法也有助于对其进行鉴别和观察。

军团菌在电子显微镜下，可见其具有独特的超微结构。其细胞壁结构与其他革兰氏阴性菌有所不同，细胞壁外有一层微荚膜，这层微荚膜可能与细菌的黏附、侵袭以及逃避宿主免疫防御等功能有关。此外，军团菌还具有菌毛，菌毛有助于细菌附着在宿主细胞表面，在感染过程中发挥重要作用。

军团菌的典型形态特点包括细长多形的杆菌形态、革兰氏染色不易着色以及独特的超微结构等，这些形态特点对于军团菌的鉴定和研究具有重要意义。