选择外科抗菌药时，主要需要考虑以下几个方面的因素：
1. 感染部位和类型：不同的感染部位可能适合不同种类的抗生素。例如，皮肤软组织感染、骨关节感染、腹腔内感染等，每种情况下的首选药物可能会有所不同。
2. 病原体敏感性：了解引起感染的具体病原微生物及其对抗生素的敏感性至关重要。通常需要通过细菌培养和药敏试验来确定最有效的治疗方案。
3. 药物特性：包括药物的吸收、分布、代谢与排泄等药代动力学特征，以及其抗菌谱、作用机制、副作用及耐药性发展风险等因素。
4. 患者个体状况：患者的年龄、体重、肝肾功能状态、过敏史等都会影响到抗菌药物的选择。例如，对于儿童或老年人来说，某些成人常用的抗生素可能并不适用；而有特殊疾病如慢性肾脏病的患者，则需特别注意药物对器官的影响。
5. 经济成本与可获得性：在保证疗效的前提下，还应考虑药品的价格和获取难度，选择性价比高且容易获得的抗菌药。
6. 预防耐药性的产生：合理使用抗生素，避免不必要的广谱抗生素滥用，减少多重耐药菌株的发生和发展。

综上所述，在选择外科抗菌药物时需综合考量以上多个方面，并结合临床实际情况作出最佳决策。