选择抗菌药物时需要综合考虑多个因素，以确保治疗的有效性和安全性。这些因素包括但不限于：
1. 病原体类型和敏感性：首先要确定感染是由哪种病原体引起的，以及该病原体对哪些抗生素敏感。这通常需要通过实验室检查（如细菌培养加药敏试验）来完成。
2. 感染部位及严重程度：不同部位的感染可能需要不同的给药途径或药物种类。例如，中枢神经系统感染往往需要能够穿透血脑屏障的抗生素；而轻度至中度皮肤软组织感染则可以首先考虑口服治疗。
3. 药物特性：包括药物的作用机制、生物利用度、半衰期、代谢途径等。这些特性会影响药物的选择和使用方式。
4. 患者个体情况：患者的年龄、体重、肝肾功能状态、过敏史等因素都会影响抗菌药物的选择。例如，老年人或有肾脏疾病的患者可能需要调整剂量；对于已知对某种抗生素有过敏反应的患者，则应避免使用该类药物。
5. 经济成本与可获得性：在保证疗效的前提下，选择经济实惠且容易获取的药物也是重要的考虑因素之一。
6. 抗菌素耐药性问题：考虑到全球范围内抗菌素耐药性的日益严重，医生应当尽量减少不必要的广谱抗生素使用，并优先选用窄谱抗生素，以降低产生耐药性的风险。

综上所述，在临床实践中选择合适的抗菌药物是一个复杂的过程，需要综合评估上述多个方面的情况。