三羧酸循环，也称为柠檬酸循环或克雷布斯循环，是在细胞的能量代谢中起着至关重要的作用。这个循环主要发生在细胞的线粒体基质内。线粒体是细胞内的能量工厂，负责产生大部分细胞所需的ATP（腺苷三磷酸）。在真核生物中，线粒体是一个双膜结构的细胞器，其中外膜相对通透，而内膜则含有许多与呼吸链相关的蛋白质复合物。
当丙酮酸通过一系列反应被转化为乙酰辅酶A后，后者进入线粒体基质，在这里与草酰乙酸结合形成柠檬酸，从而启动三羧酸循环。随着循环的进行，柠檬酸经过多次氧化和脱羧反应，最终重新生成草酰乙酸，同时释放出二氧化碳，并将电子传递给NAD 和FAD等辅酶，这些辅酶随后参与呼吸链中能量的进一步转化过程。
因此，可以明确地说，三羧酸循环发生的具体场所是细胞线粒体内的基质部分。这一过程对于生物体内有机物的分解代谢、ATP的生成以及多种重要分子的合成均具有重要意义。
