特殊使用级抗菌药物是指那些具有明显或严重不良反应，且不作为常规治疗首选的抗菌药物；或者在临床应用中需要特别限制使用的抗菌药物。这类药物的使用应当严格遵循以下原则：

首先，特殊使用级抗菌药物的应用必须基于明确的医学指征。通常情况下，这类药物用于治疗对其他抗菌药物耐药或无效的严重感染，如多重耐药菌引起的感染、免疫功能低下患者的重症感染等。

其次，在决定使用特殊使用级抗菌药物前，应尽可能进行病原学检查，包括但不限于细菌培养和药敏试验，以确定感染的具体病原体及其对抗菌药物的敏感性。这有助于指导临床医生选择最合适的治疗方案，减少不必要的广谱抗菌药物使用，降低耐药性的发生。

再次，特殊使用级抗菌药物的处方应由具有相应资质的医师开具，并且在使用过程中需要密切监测患者的病情变化及药物不良反应，必要时及时调整治疗方案。对于某些高风险患者（如儿童、老年人或有严重基础疾病者），更需谨慎评估其用药的安全性和有效性。

最后，医疗机构应当建立和完善抗菌药物管理制度，包括但不限于制定特殊使用级抗菌药物的临床应用指南，定期对医务人员进行培训和考核，以及开展抗菌药物合理使用的监督与评价工作。通过这些措施，可以有效促进抗菌药物的规范管理，提高感染性疾病治疗水平，保障患者健康权益。

总之，正确合理地使用特殊使用级抗菌药物是控制细菌耐药性、保证医疗质量和安全的重要环节之一。