医疗机构在规范使用抗菌药物方面需要严格遵守国家的相关法律法规和临床指南，确保合理用药，减少耐药性的发展。具体措施包括：

首先，医疗机构应建立健全的抗菌药物管理制度，明确抗菌药物使用的指征、流程及权限。这要求医院内部设立专门的管理机构或小组，负责监督抗菌药物的应用情况，并定期组织培训，提高医务人员对抗菌药物使用规范的认识。

其次，在临床实践中，医生应当根据患者的具体病情和实验室检查结果选择合适的抗菌药物，遵循“能不用就不用，能少用不多用”的原则。对于轻症感染或者疑似病毒感染的病例，不应随意开具抗生素处方；对于重症或混合性感染，则应在保证疗效的前提下尽量减少广谱抗生素的应用。

再次，医疗机构需要加强对抗菌药物使用情况的监测与评估，建立完善的数据收集系统，定期分析抗菌药物使用量、品种分布及耐药率等信息。一旦发现异常增长趋势或者高耐药率现象，应及时采取干预措施，如调整用药方案、限制特定种类抗生素的使用范围等。

最后，医院还应积极推广合理使用抗菌药物的知识教育活动，提高患者和社会公众的认知水平，减少不必要的自我用药行为，共同维护公共卫生安全。

通过上述措施的有效实施，可以有效规范医疗机构对抗菌药物的管理与应用，促进医疗质量和服务水平的持续提升。