阿托品是一种抗胆碱药，它能够阻断乙酰胆碱对M型胆碱受体的作用。在消化系统中，阿托品主要影响胃肠道的平滑肌功能，具体表现在以下几个方面：
1. 抑制胃肠平滑肌收缩：阿托品可以显著降低胃肠道平滑肌的张力和收缩幅度，从而减少胃肠道运动。这有助于缓解胃肠道痉挛引起的腹痛、绞痛等症状。
2. 影响胃排空：由于阿托品能够抑制胃部平滑肌的活动，因此它可以减缓食物从胃进入小肠的速度，延长胃内食物停留时间，但这种作用并不总是显著，因为胃排空还受到其他因素的影响。
3. 减少胃酸分泌：阿托品通过阻断M1和M2受体，抑制壁细胞上的乙酰胆碱作用，从而减少胃酸的分泌。这对于治疗某些与高胃酸分泌相关的疾病（如消化性溃疡）具有一定的辅助作用。
4. 影响Oddi括约肌：Oddi括约肌位于十二指肠乳头周围，控制胆汁和胰液进入小肠的过程。阿托品能够放松Oddi括约肌，有助于改善胆道梗阻或胰腺炎患者的症状。
5. 对肠道其他部位的影响：除了上述作用外，阿托品还会影响整个消化道的平滑肌功能，包括大肠和平滑肌细胞间的连接，从而影响肠道蠕动和排便过程。然而，这种效应在临床上并不总是显著，且可能因个体差异而异。

综上所述，阿托品通过抑制胆碱能神经传递，对胃肠道平滑肌产生广泛的影响，主要用于缓解胃肠痉挛、减少胃酸分泌及改善Oddi括约肌功能等方面。在临床应用时需注意剂量控制和个体反应的差异性。