机体能够通过复杂的免疫系统来识别并结合特定的抗原分子。这个过程主要涉及到先天性免疫和适应性免疫两个方面，但具体到抗原的识别与结合，则更多地依赖于适应性免疫系统的功能。

在适应性免疫中，有两大类细胞负责这一任务：T淋巴细胞（简称T细胞）和B淋巴细胞（简称B细胞）。它们各自通过不同的机制来识别并应对特定的抗原分子。
1. T细胞对抗原的识别：T细胞表面有一种特殊的蛋白质称为T细胞受体(TCR)，它能够与由主要组织相容性复合物(MHC)呈递在细胞表面上的肽段（即抗原片段）结合。MHC分子负责将抗原处理后的肽段展示给免疫系统，而TCR则通过识别这些特定的肽-MHC复合物来区分“自我”和“非我”。每个T细胞上的TCR都是独一无二的，这样就能确保机体可以对抗几乎无限种类的潜在病原体。
2. B细胞对抗原的识别：与T细胞不同的是，B细胞直接通过其表面的抗体（也称为B细胞受体, BCR）来识别完整的抗原分子。当一个特定形状或结构的抗原分子能够匹配到某个B细胞上的BCR时，这种结合会触发该B细胞活化、增殖，并分化成产生大量特异性抗体的浆细胞。这些抗体随后被释放入血液中，在体液免疫反应中发挥重要作用。

整个过程中，机体通过基因重组机制确保了T细胞和B细胞受体的高度多样性，使得即使面对未曾遇到过的新型抗原，也能迅速生成相应的应答。此外，记忆性T/B细胞的形成保证了再次遭遇相同抗原时能够更快更有效地产生免疫反应，这就是疫苗接种背后的科学原理之一。