克罗恩病是一种病因尚不十分清楚的胃肠道慢性炎性肉芽肿性疾病，典型症状较为多样，涉及消化系统及全身多个方面。
消化系统症状方面，
腹痛是最常见的症状，多位于右下腹或脐周，呈间歇性发作，常为痉挛性阵痛伴肠鸣增加。疼痛的发生可能与肠内容物通过炎症、狭窄肠段，引起局部肠痉挛有关。腹泻也是常见表现，先是间歇发作，病程后期可转为持续性。粪便多为糊状，一般无脓血或黏液，这是因为病变肠段的炎症、蠕动增加及继发性吸收不良所致。部分患者还可能摸到腹部包块，多位于右下腹与脐周，是由于肠粘连、肠壁增厚、肠系膜淋巴结肿大、内瘘或局部脓肿形成所致。另外，瘘管形成是克罗恩病的特征性临床表现，因透壁性炎性病变穿透肠壁全层至肠外组织或器官而成。分内瘘和外瘘，前者可通向其他肠段、肠系膜、膀胱、输尿管等，后者通向腹壁或肛周皮肤。
全身症状上，发热较为常见，一般为低热或中度热，少数呈弛张高热伴毒血症。发热主要由肠道炎症活动及继发感染引起。营养障碍也较为突出，表现为体重下降、消瘦、
贫血、低蛋白血症等，这与慢性腹泻、食欲减退及慢性消耗等因素有关。
此外，克罗恩病还可能出现一些肠外表现，如口腔黏膜溃疡、皮肤结节性红斑、
关节炎、虹膜睫状体炎等，这些肠外表现可能与自身免疫反应有关。
