细菌感染的来源主要分为外源性感染和内源性感染两大方面。

外源性感染指病原体来自宿主体外，主要包括以下几种情况。一是患者，细菌感染的患者可通过多种方式将细菌传播给他人。例如，患有肺结核的患者通过咳嗽、咳痰等方式，将结核分枝杆菌排出体外，健康人吸入含有该菌的飞沫后就可能被感染。二是带菌者，这类人虽然没有明显的临床症状，但体内携带并能排出病原体。比如伤寒带菌者，他们可在其粪便中持续排出伤寒杆菌，污染水源和食物，进而引起他人感染。三是病畜和带菌动物，一些细菌可在动物和人之间传播。如布鲁菌可感染牛、羊等家畜，人在接触感染动物的分泌物、肉类或饮用未消毒的奶制品时，就可能感染布鲁菌病。此外，环境也是重要的外源性感染源，土壤中存在破伤风梭菌等细菌，当人体有伤口并接触到被污染的土壤时，就可能引发破伤风。水和空气中也可能含有各种细菌，如军团菌可在空调冷却水等水环境中生存，随气溶胶被人体吸入后可导致军团菌肺炎。

内源性感染的细菌来自患者自身。正常情况下，人体体表和与外界相通的腔道黏膜表面存在着大量的正常菌群，它们与人体处于相对平衡状态。但当机体免疫力下降时，如患恶性肿瘤、艾滋病或长期使用免疫抑制剂等，原本不致病的正常菌群就可能成为条件致病菌而引起感染。此外，当正常菌群的寄居部位发生改变时，也可能导致感染。例如，大肠埃希菌通常存在于肠道，但如果因手术等原因进入腹腔或泌尿系统，就可能引起相应部位的感染。