大环内酯类抗生素和林可霉素类抗生素在抗菌谱方面既有相同点，也有不同点。

相同点：两者都对革兰阳性菌有良好的抗菌作用。对于金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肺炎链球菌、溶血性链球菌等革兰阳性球菌，大环内酯类抗生素如红霉素、阿奇霉素等，以及林可霉素类的林可霉素和克林霉素都具有一定的抗菌活性，能够抑制这些细菌的生长和繁殖，在治疗由这些革兰阳性菌引起的呼吸道感染、皮肤软组织感染等方面都可能发挥作用。

不同点：首先，大环内酯类抗生素对部分革兰阴性菌也有抗菌作用。比如对流感嗜血杆菌、百日咳鲍特菌、淋病奈瑟菌等有一定的抗菌活性，在治疗由这些革兰阴性菌导致的相关疾病时可作为选择药物之一。此外，它还对非典型病原体如支原体、衣原体、军团菌等有强大的抗菌作用，在治疗支原体肺炎、衣原体感染以及军团菌病等方面是重要的治疗药物。而林可霉素类抗生素对革兰阴性菌的抗菌作用相对较弱，其抗菌谱主要集中在革兰阳性菌上。不过，林可霉素类抗生素对厌氧菌有良好的抗菌活性，尤其是对消化链球菌、破伤风杆菌、产气荚膜杆菌等厌氧菌有较强的抑制作用，在治疗厌氧菌引起的腹腔感染、盆腔感染等方面有独特的优势，而大环内酯类抗生素对厌氧菌的作用相对较差。

综上所述，大环内酯类和林可霉素类抗生素虽然在对革兰阳性菌的抗菌上有重叠，但在对革兰阴性菌、非典型病原体以及厌氧菌的抗菌方面存在明显差异。临床医生会根据不同的病原菌感染情况，合理选择使用这两类抗生素。