血栓形成对机体的影响具有两面性，既有有利的一面，也有不利的一面。
有利影响主要体现在生理性止血过程中。当血管损伤时，在血管破损处形成的血栓能够堵塞伤口，阻止出血，避免机体因大量失血而危及生命。例如，日常生活中不小心割破手指，伤口处很快会形成血凝块，这其实就是血栓的雏形，它能起到暂时封闭伤口、防止继续出血的作用，为后续组织的修复创造条件。
然而，更多时候血栓形成会对机体造成不利影响，主要包括以下几个方面。首先是阻塞血管。如果血栓形成于动脉，且完全阻塞管腔，而该动脉又缺乏有效的侧支循环时，会导致相应组织器官发生缺血性坏死。比如冠状动脉血栓形成，可引发
心肌梗死，严重影响心脏功能，甚至危及生命；脑动脉血栓形成可导致脑梗死，引起偏瘫、失语等严重的神经系统症状。若血栓形成于静脉，可引起局部淤血、水肿、出血，甚至坏死。其次是栓塞。当血栓与血管壁黏着不牢固或部分软化、碎裂时，血栓的整体或部分可以脱落成为栓子，随血流运行，阻塞其他部位的血管。如下肢深静脉内的血栓脱落后，可随血流运行至肺动脉，引起肺动脉栓塞，严重的肺动脉栓塞可导致患者猝死。再者是心瓣膜变形。风湿性心内膜炎和感染性心内膜炎时，心瓣膜上反复形成的血栓发生机化，可使瓣膜增厚、变硬、卷曲、缩短，瓣叶之间发生粘连，从而导致瓣膜狭窄或关闭不全，影响心脏的正常功能。另外，弥漫性血管内凝血（DIC）时，微循环内广泛形成的微血栓会消耗大量的凝血因子和血小板，导致继发性纤维蛋白溶解系统功能亢进，引起全身广泛出血和
休克，严重威胁患者生命。
