输卵管绝育术是一种常见的女性绝育方法，但也可能会引发一些并发症，主要包括以下几方面。
近期并发症有出血或血肿，多因术中过度牵拉、钳夹而损伤输卵管或其系膜造成，或因创面血管结扎不紧引起，出血或血肿可发生在腹壁、输卵管系膜内及腹腔内。感染包括局部感染和全身感染，可发生切口感染、盆腔与腹腔感染等，多因手术操作无菌观念不强，合并有体内原有感染灶未处理等导致，严重者可并发败血症性
休克。脏器损伤，主要为膀胱、肠管损伤，多因解剖关系辨认不清或操作粗暴所致。
远期并发症方面，有输卵管再通，其原因可能是绝育措施本身缺陷，也可能是施术时技术误差引起，再通后可导致再孕或异位妊娠。还有慢性盆腔痛，部分受术者术后出现慢性盆腔疼痛，可能与手术操作时对组织的损伤、粘连、术后精神因素等有关。另外，神经官能症也可能发生，有的受术者术后出现情绪波动、焦虑、抑郁等神经精神症状，可能与受术者术前精神状态及对手术的认知不足有关，加之术后身体出现一些不适，心理负担加重而引发。
输卵管绝育术虽然是一种相对安全有效的绝育方式，但医生在手术过程中应严格遵守操作规程，尽量减少并发症的发生，同时受术者术前也应充分了解手术相关情况，做好心理准备。
