约 10一 17％可发生不良反应，主要为轻度的胃肠道反应，如恶心、胃纳减退、中上腹不适、稀便或轻度腹泻等，一般不影响继续用药。偶可发生皮疹、嗜酸粒细胞增多、丙氨酸氨基转移酶升高等，未见肾、血液系统等的毒性反应。肌注磷霉素钠时局部疼痛较剧。
不良反应一般较轻.可引起胃肠道反应：恶心,呕吐,食欲不振,腹胀,腹泻.过敏性皮疹.转氨酶升高.肌注局部疼痛,硬结.静脉用药可有血栓性静脉炎,心悸.
本品使用安全，有肝、肾功能减退者不需调整剂量。口服可能有恶心、纳减、中上腹不适或稀便、轻泻等轻度胃肠道反应，一般不影响治疗。偶发皮疹、嗜酸粒细胞增多或—过性转氨酶升高。临床应用3000多例，未发现肾脏或血液系统的毒性反应。
对于心、肾功能不全、高血压等患者慎用。本品毒性虽较轻，但仍可致皮疹、嗜酸细胞增多、血氨基转移酶升高等反应。口服可致胃肠道反应；肌注局部疼痛和硬结；静脉给药过快可致血栓性静脉炎、心悸等。
