氨基甙类抗生素的安全范围较窄，其主要是对肾脏和第八对脑神经的损害。其他不良反应尚有阻断或胳肌的神经肌肉接头及过敏反应等。

　　（1）肾霉素：庆大霉素、卡那霉素、主管药师药理学辅导精华妥布霉素等均对肾脏有毒性，其中以卡那霉素毒性较大，链霉素和妥布霉素仅有较轻微损害作用。各种氨基甙类抗生素对肾脏的毒性与药物在肾皮质的积聚量成正比。由于氨基甙类的体内分布有内脏亲的性，能快速经过近曲小管细胞摄取，浓缩蓄积于肾皮质，其药物浓度可高达血浆浓度的10~20倍，且由于进入上皮质细胞内的药物分解破坏很慢，半衰期长，易造成毒性累积。链霉素、妥布霉素等药物在肾组织结合较少，因此肾毒性较轻。氨基甙类肾损害病理主要为急性近曲小管变性、坏死、断后损伤肾间质。

　　（2）耳毒性：本类任何一种药物均可引起第八对脑神经的前庭或耳蜗损害，但各有侧重，损害的程度也有差异，如新霉素、卡那霉素、丁胺卡那霉素与乙基西梭霉素以损害耳蜗功能为主，表现为耳鸣与不同程度的听力减退，严重者可引起耳聋。发生率的报道不一约在3%~24%之间。链霉素、庆大霉素主要损害前庭功能，表现为晕眩、恶心、呕吐、眼球震颤和平衡失调。妥布霉素对耳蜗和前庭功能有同等的损害作用。一般认为耳毒性与氨基甙类特异分布有关，已知在内耳的外淋巴中浓度很高（超过血药浓度670倍），且消除缓慢（耳液半衰期比血浆长5~6倍）。经研究证明，本类抗生素主要影响维持内淋巴离子平衡的主动转运系统，医学教育网|收集整理使迷路液中正常的离子浓度改变，因而损伤柯蒂氏器的前庭及耳蜗感觉毛细胞的活动及神经传递，最后造成毛细胞变性及不可逆损伤（感觉毛细胞不能再生），而导致永久性耳聋。

　　（3）阻断神经肌肉接头：多见于手术时腹腔内放置大剂量或大剂量静滴后产生，表现为急剧出现的肌无力和呼吸麻痹。尤以乙醚、硫喷妥钠麻醉病人，以及使用肌松剂者，肾功能损害及低钙症患者易发生。经动物研究表明，此系氨基甙类抑制突触前膜乙酰胆碱的释放，并降低突触后膜对递质乙酰胆碱的敏感性所致。