尽管IMI通道在SE-9000中运用的原意是用来检测幼稚白细胞，而美国Loma Linda大学和日本Osaka大学在1995年报道了此通道也可用来检测干细胞。在医学治疗领域的新方法中，外周血干细胞移植（PBSCT）提供了一种有潜力代替骨髓移植的新方法，外周血干细胞移植通常需要0.5×105CFU-GM(粒细胞巨噬细胞-集落生成单位)/kg量。为了取得足量的干细胞，需要准确预测最佳干细胞收获时间,最理想的方法是对干细胞定量，然而应用流式细胞技术和CFU-GM集落鉴定术需要相对较高的成本和很长的时间，而应用SE-9000和其他相类似仪器的IMI通道来监测IMI阳性细胞，就可以知道最佳外周血干细胞收获时间，其特点是快速和价格低廉。
