（一）隐蔽抗原的释放
隐蔽抗原是指某些与免疫系统在解剖位置上隔绝的抗原成分。如精子、眼内容物等。手术、外伤、感染等因素破坏隔绝屏障，隐蔽抗原释放入血流或淋巴液，与免疫系统接触，引发自身免疫应答，导致自身免疫性疾病的发生医|学教育网搜集整理。
（二）自身抗原成分的改变
物理、化学、生物因素可以使自身抗原抗原性改变，改变的自身抗原可引起自身免疫性疾病。例如：变性IgG刺激机体，产生抗变性IgG抗体（RF），引起RA.
（三）共同抗原的诱导
多种病毒、细菌与正常人体某些组织细胞或细胞外成分有相类似的抗原决定基，针对这些抗原决定基的免疫应答可以引起起自身免疫性疾病。例如：A群β溶血性链球菌与人的心肌间质或肾小球基底膜有共同抗原，所以在链球菌感染后容易发生风湿性心脏病或肾小球肾炎。
