ABO血型系统也是主要组织相容性抗原。ABO系统的抗原不仅存在于红细胞，亦存在于血管内皮及其他组织细胞表面，当供者与受者的ABO血型不符时，移植物的血循环重建后会即刻导致严重的排斥反应而使移植失败。但是ABO血型只有4种主要类型，容易检测也容易配型。在进行器官移植时，力求供受体间ABO血型的一致。ABO血型抗体系天然抗体。其他血型物质也可以构成触发移植排斥反应的靶抗原医|学教育网搜集整理。
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