临床微生物学除了常规的实验室检查方法以外，目前免疫学检测技术、发光分析技术、鲎试验和分子生物学技术的应用也较广泛起来。
（一）免疫检测技术
微生物学中常用的免疫检测技术包括凝集反应、沉淀反应、补体结合试验、免疫荧光技术、酶免疫测定及皮肤反应等。
（二）发光分析技术
发光分析技术是依赖酶或化学反应释放能量引起发光物质（如鲁米诺、荧光素等）发光的检测方法。具有操作简便、快速、敏感度高、无污染特点。根据发光原理，主要分为生物及化学发光两种方法。
（三）鲎试验（检测内毒素）
鲎变形细胞溶解物试验简称鲎试验。其基本原理是内毒素在碱性金属离子存在下激活鲎试剂中凝固酶原转变为凝固酶，凝固酶使存在于鲎试剂中的凝固蛋白原生成凝固蛋白，产生凝胶医学。教育网整理。凝胶的形成速度及其坚固程度与内毒素浓度有关。鲎试验阳性表明有革兰染色阴性菌或内毒素血症，也可用于生物制品或注射液的内毒素污染检测。
（四）分子生物学在病原微生物中的应用
对生物体的基因组DNA片段及其转录产物进行定性和定量分析，进而对人体状态和疾病作出诊断。基因诊断技术可克服病原微生物的传统检测方法灵敏度低、特异性低及速度慢等不足之处，并可用于流行病学的大量现场筛查工作。
