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应与其他肠道感染的预防工作共同进行，特别应注意以下几点：①适当处理粪便；②食前洗手；③水果和生吃的蔬菜要洗净；④有阿米巴包囊者必须治疗，特别是与患儿同居者更应积极治疗，以肃清病原；⑤在流行地区对群众应加强卫生宣教，消灭苍蝇和蟑螂的孳生地，加强水源的管理。
阿米巴感染的总死亡率为2.2%，其中由于肝脓肿、肺、脑、胸腔、心包并发症者占多数。由于肠道阿米巴病而致肠穿孔或肠坏死者，仅属少数。估计每100个肠病中有1个并发肝脓肿，其病死率为10%。
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