（一）社区获得性肺炎
即医院外感染，致病菌仍以肺炎球菌最为常见，约占40%.其次为流感嗜血杆菌、肺炎支原体、葡萄球菌、肺炎克雷伯杆菌、肺炎军团菌等。
（二）医院内获得性肺炎
即医院内感染，病理环境和医疗器械的污染，以及全身和呼吸道局部免疫防御功能的降低，从而使病原体更趋复杂多变。病原菌以需氧革兰阴性杆菌引起者最为常见，其中常见的病原菌有绿脓杆菌医`学教育网搜集整理、肺炎克雷伯杆菌、肠杆菌属等。近年来金黄色葡萄球菌感染有上升趋势，占医院内感染的5%～20%.以往较少见的军团菌肺炎亦相继出现。
此外，近年来因免疫功能低下所致肺部感染亦逐渐增加。获得性免疫缺陷综合征（AIDS）或其他伴有免疫缺陷的疾病，如白血病、淋巴瘤、恶性肿瘤、器官移植或长期使用激康、免疫抑制剂者，均因免疫功能降低易患肺部感染。其病原体除主要为革兰阴性杆菌、金鼹色葡萄球菌、厌氧菌、真菌等外，尚可有卡氏肺孢子虫、巨细胞病毒、非典型分枝杆菌等引起的感染。
近年来细菌耐药情况不断增加，由耐药菌引起的肺部感染已达18%～35%，常见的耐药菌有葡萄球菌、绿脓杆菌、肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌等。耐药菌株可通过质粒或染色体将其耐药性传递给下一代，致使抗生素的疗效受到限制。
