全科医生岗位培训虽然也是卫生部安排，但是均由各省卫生厅牵头大多在各地市区举办 ，时间三到四个月结束。
而基层医疗卫生机构全科医生转岗培训，是国家发改委、卫生部、中央编办、教育部、财政部、人力资源和社会保障部医学教育.网编辑整理、等六部委为贯彻国务院关于建立全科医生制度的指导意见。联合举办并由卫生部牵头全国统一进行为期一年的理论和临床实践，同时转岗理论培训要求在医科大学，临床轮转在三甲医院进行。学习的各个阶段都有严格的考试考核，合格者方能获得卫生部统一格式的转岗培训合格证书，由此可以看出二者的知识含金量明显不同。全科医生转岗培训是国家近期培养合格全科医生的主要途径。
