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主要采用抗病毒治疗。治疗的目的主要是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程及防止继发感染等。目前的治疗方法尚不能达到彻底清除病毒、消除复发的效果。
1.生殖器疱疹的一般疗法
(1)主要是保持局部清洁、干燥。可每天用等渗生理盐水清洗，疼痛者可口服止痛药，给予精神安慰。
(2)并发细菌感染者，可外用抗生素药膏。
(3)局部疼痛明显者，可外用5%盐酸利多卡因软膏或口服止痛药。
(4)心理支持，说明疾病的性质、复发的原因和如何治疗及处理，增强与疾病斗争的信心。
2.生殖器疱疹抗病毒药治疗
推荐采用的治疗方案包括：阿昔洛韦，口服，每天5次;或阿昔洛韦，口服，每日3次;或伐昔洛韦，口服，每天2次;或泛昔洛韦，口服，每天3次。如果是初发生殖器疱疹，疗程为7～10天;复发性生殖器疱疹疗程为5天。频发复发者则需以较低的剂量服用较长时间的疗程。
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