主要的农村公共卫生问题包括以下几个方面：
1. 传染病防控：在一些地区，由于卫生条件较差、健康教育不足等原因，传染病如肝炎、结核等仍然较为常见。
2. 慢性病管理：随着生活方式的变化，慢性疾病（如高血压、糖尿病）在农村地区的发病率逐年上升。这些疾病的早期发现和持续管理对于预防并发症至关重要。
3. 妇幼保健：提高妇女儿童健康水平是公共卫生工作的重要内容之一。特别是在偏远地区，需要加强对孕产妇及婴幼儿的健康管理和服务。
4. 饮水安全与环境卫生：许多农村地区存在饮用水不达标、厕所设施落后等问题，这不仅影响居民生活质量，也是导致多种疾病发生的重要因素。
5. 职业健康问题：部分农民长期从事农业生产活动，可能面临农药中毒、尘肺病等职业性危害。因此，加强农业劳动保护和安全教育十分必要。
6. 心理卫生服务：随着社会经济的发展变化，农村居民面临的心理压力日益增大，但心理卫生资源相对匮乏，需要给予更多关注和支持。
7. 健康教育与促进：提高农民群众的健康意识和自我保健能力是改善农村公共卫生状况的关键。通过开展多种形式的健康宣传教育活动，可以有效提升村民对常见疾病的认知水平。

以上这些问题都是当前我国农村地区面临的主要公共卫生挑战，在具体工作中需要根据实际情况采取针对性措施加以解决。