在乡村全科执业助理医师的工作中，遇到以下情况时需要考虑将患者转诊到更高级别的医疗机构进行进一步诊治：
1. 当诊断不明确或存在复杂疾病时。例如，患者出现不明原因的体重下降、持续性发热等症状，且经过初步检查无法确定病因。
2. 患者病情危急或有生命危险的情况。如急性心肌梗死、严重创伤等需要紧急手术或其他专科治疗的状况。
3. 需要特殊设备和专业技术进行诊断与治疗时。比如，复杂的影像学检查（CT、MRI）、内镜检查以及某些特定药物的使用等。
4. 患者有慢性病且病情控制不佳或者出现并发症时。例如糖尿病患者血糖长期控制不良或出现视网膜病变等症状。
5. 心理健康问题超出乡村医生处理能力范围的情况，如严重抑郁、焦虑障碍等需要精神科专业人员评估和治疗的状况。
6. 儿童生长发育异常或其他儿科专科疾病也需要及时转诊至儿童医院接受专业诊疗。
7. 患者有特殊需求或希望获得更高级别医疗服务时。如果患者要求在大医院进行手术、化疗等治疗，医生应尊重其意愿并协助办理相关手续。

总之，在确保患者安全的前提下，乡村全科执业助理医师应当根据实际情况判断是否需要转诊，并选择合适的医疗机构为患者提供更好的医疗保障。