在治疗甲状腺功能减退时，主要需要监测的是血液中的甲状腺激素水平。具体来说，通常会定期检测血清中的促甲状腺激素（TSH）和游离甲状腺素（FT4）的浓度。这两个指标可以帮助医生了解药物剂量是否合适以及病情是否有改善。
1. 促甲状腺激素（TSH）：这是由脑下垂体分泌的一种激素，可以反映甲状腺的功能状态。在甲状腺功能减退症患者中，未经治疗或治疗不足的情况下，TSH水平通常会升高。随着治疗的进行，目标是将TSH调整到正常范围内。
2. 游离甲状腺素（FT4）：这是指血液中未与蛋白质结合、能够自由进入细胞发挥作用的甲状腺素部分。监测游离T4可以帮助评估患者体内有效的甲状腺激素水平是否达到正常范围。
医生会根据这些指标的变化来调整治疗方案，比如调整左旋甲状腺素钠片等药物的剂量，以确保患者的甲状腺功能维持在一个理想的范围内。同时，在治疗过程中还需要关注患者是否有不良反应或症状改善的情况，并结合临床表现综合判断治疗效果。
