确保健康档案信息安全是医疗卫生工作中非常重要的一环，尤其对于乡村全科助理医师来说更是如此。下面是一些基本措施和建议：
1. 建立健全的管理制度：制定明确的信息安全管理政策和流程，包括数据的收集、存储、传输和销毁等各个环节的安全管理规定。
2. 加强人员培训：定期对医护人员进行信息安全意识教育和技术培训，提高他们保护患者隐私的责任感和能力。
3. 采用加密技术：使用安全可靠的加密算法来保护敏感信息，在数据传输过程中也要采取相应的加密措施。
4. 实施访问控制：为不同级别的用户设定不同的权限范围，确保只有授权人员才能查看或修改特定的健康档案资料。
5. 定期备份与恢复测试：建立定期的数据备份机制，并进行恢复演练以检验备份的有效性，防止因意外情况导致数据丢失或损坏。
6. 加强物理安全防护：确保存放纸质和电子版健康档案的地方具备良好的防盗、防火等设施。
7. 遵守法律法规要求：了解并遵守国家关于医疗信息保护的相关法律规范，如《中华人民共和国网络安全法》、《医疗机构管理条例》等。

通过上述措施的实施，可以有效提升乡村全科助理医师在日常工作中对患者健康档案信息安全的管理水平。