慢性阻塞性肺疾病（COPD）是一种常见的呼吸系统疾病，其特点是气流受限不完全可逆，并且呈进行性发展。在基层医疗机构中，乡村全科执业助理医师需要具备识别和初步处理COPD的能力，但当遇到以下情况时，应当及时将患者转诊至上级医院：
1. 初次诊断为慢性阻塞性肺疾病：对于首次被怀疑患有COPD的患者，尤其是症状严重或存在不典型表现时，应考虑转诊。这有助于获得更精确的诊断和治疗建议。
2. 病情急性加重：当患者出现明显的呼吸困难加剧、咳嗽加重伴有大量脓痰或者血痰、发热等症状，并且常规处理效果不佳时，表明病情可能已经进入急性加重期，需要进一步评估和治疗。
3. 持续性低氧血症或高碳酸血症：如果患者在使用氧气疗法后仍存在持续性的低氧血症（动脉血氧分压<60mmHg）或高碳酸血症（二氧化碳分压>50mmHg），应考虑转诊，以评估是否需要长期家庭氧疗或其他治疗措施。
4. 合并症管理困难：如患者同时患有心力衰竭、糖尿病等其他慢性疾病，并且这些合并症难以通过基层医疗机构的资源有效控制时，也应当转诊至具备相应专科能力的医院。
5. 药物副作用或疗效不佳：如果常规使用的支气管扩张剂和吸入性糖皮质激素等药物出现严重不良反应，或者经过规范治疗后症状改善不明显，则需要上级医院的专业医生调整治疗方案。
6. 需要进行特殊检查或手术：如需做肺功能测试、CT扫描、支气管镜检等复杂检查，或是考虑外科干预时，应转诊至具备相应设备和技术力量的医疗机构。

总之，在处理COPD患者的过程中，乡村全科执业助理医师应当根据患者的实际情况灵活判断是否需要转诊，并及时与上级医院沟通协调。