在进行初步检查以判断患者出现尿急、尿频和尿痛症状的原因时，可以采取以下几个步骤：

首先，详细询问病史。了解患者的年龄、性别、生活习惯等基本信息；重点询问尿急、尿频、尿痛的起始时间、持续情况及是否伴有其他症状（如发热、腰痛、血尿等）。此外，还需关注患者是否有过泌尿系统感染的历史或是否存在性传播疾病的风险因素。

其次，进行体格检查。注意观察患者的一般状况，特别是腹部和下腰部有无压痛点；对男性患者应检查前列腺是否肿大；女性则需排除妇科疾病的可能。

接着，实验室检查是不可或缺的一部分。常规的尿液分析可以发现白细胞、红细胞及细菌等异常情况，有助于诊断泌尿系统感染。必要时可进行尿培养以确定致病菌种及其敏感抗生素。血常规检查也能为判断是否存在全身性感染提供线索。

影像学检查如B超、CT等，在怀疑有结石、肿瘤等情况时作为进一步的辅助手段使用。

根据上述检查结果，医生可以初步判断导致患者出现尿急、尿频和尿痛的原因可能是泌尿系统感染（包括膀胱炎、肾盂肾炎）、前列腺疾病、尿道综合征、泌尿系结石或肿瘤等问题。需要注意的是，在明确诊断前不应随意使用抗生素治疗，以免影响后续的病原学检查结果。

最后，根据初步判断的结果制定合理的诊疗计划，并密切观察病情变化，适时调整治疗方案。在必要时转诊至上级医院进行更深入的诊治。