小儿缺铁性贫血是由于体内铁缺乏导致血红蛋白合成减少而引起的一种贫血，其病因主要包括以下几个方面。

首先是先天储铁不足。胎儿从母体获得的铁以妊娠最后3个月最多，所以早产、双胎或多胎、胎儿失血和孕母严重缺铁等均可使胎儿储铁减少。例如，早产的宝宝，由于在母体内发育时间不足，未能充分储存足够的铁元素，出生后更容易发生缺铁性贫血。

其次是铁摄入量不足。这是小儿缺铁性贫血的主要原因。人乳、牛乳、谷物中含铁量均低，如不及时添加含铁丰富的辅食，就容易导致宝宝铁摄入不足。比如，有的家长在宝宝6个月后仍未及时添加含铁的米粉、肉类等辅食，就会增加缺铁性贫血的发生风险。

再者是生长发育因素。婴儿期生长发育较快，随着体重增加，血容量也增加较快，1岁时血液循环中的血红蛋白增加2倍；未成熟儿的体重及血红蛋白增加倍数更高；如不及时添加含铁丰富的食物，则易致缺铁。例如，快速生长的宝宝对铁的需求量明显增加，如果不能满足其需求，就容易出现缺铁。

另外，铁的吸收障碍也会导致缺铁。食物搭配不合理可影响铁的吸收，慢性腹泻不仅会增加铁的排泄，还会影响铁的吸收。比如，宝宝经常腹泻，肠道对铁的吸收功能就会受到影响，从而导致体内铁缺乏。

最后是铁的丢失过多。正常婴儿每天排泄铁量相对比成人多。每1ml血约含铁0.5mg，长期慢性失血可致缺铁，如肠息肉、梅克尔憩室、膈疝、钩虫病等可致慢性失血。此外，用不经加热处理的鲜牛奶喂养的婴儿可因对牛奶过敏而致肠出血。

综上所述，先天储铁不足、铁摄入量不足、生长发育因素、铁的吸收障碍以及铁的丢失过多等多种因素都可能导致小儿缺铁性贫血的发生。