各有关单位:
近年来,随着我国精准医疗产业迅速发展,精准医疗技术的研究与应用取得了长足的进步。精准医学研究作为科技部国家重点研发计划重点专项,对构建国家大型健康队列和重大疾病专病队列,建立多层次生物医学大数据共享平台,建立大规模疾病预警、诊断、治疗与疗效评价体系等方面具有重要意义,是显著提升人口健康水平、实施健康中国战略过程中不可或缺的一部分。
精准医学的最终目的是实现对于疾病和特定患者的个体化精准治疗,提高疾病的诊治与预防效益,而精准用药正是实现这一目标的重要环节。在医药分开持续推进的过程中,药师转型的速度明显加快,药师群体也希望提升自身业务水平以适应这次改革浪潮。同时,近几年基因检测飞速发展,测序技术的突破也带动了药物基因组学的发展,这为临床提出了更高要求。为进一步推动我国生物信息学方面的发展,提高从业人员的技术水平,由北京中科云畅应用技术研究院举办“精准医学与药物基因组数据分析”高级培训班,并由北京中科润开生物科技有限公司具体承办,具体事宜通知如下:
一、课程特点:
1、系统介绍科研项目如何从大思路着眼进行海量数据挖掘;
2、结合各大项目实践经验,详细介绍多种数据分析软件的使用方法;
3、理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行;
4、精心挑选相应的上机软件,为每位学员提供实际操作的机会;
5、课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答。
二、培训对象:
生命组学科、精准医学和中医药研究机构、临床科研人员,大学、医院等专家学者。大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、教研室骨干人员、教学管理人员;科研单位从事医学、生物、生命科学、相关人员;生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。
三、时间地点: 2018年11月9日——11月12日 北京
(时间安排:第1天报到,授课3天)
四、培训内容:
章节 | 内容 |
基因组学技术在临床中的应用 | 1.外显子捕获测序(WES)技术 2.WES筛选疾病致病基因策略 3.基于NGS的肿瘤个体化数据分析 4.临床案例分析 5.生存分析基本概念以及常用分析方法 |
基因组学技术在致病基因发现 | 1.药物基因组学分析 2.临床案例分析 3.应用二代测序技术研究发病机理、开发临检标志物 |
宏基因组与精准医疗 | 1.16SrDNAAMPLICONSEQUENCING法 1.1.测序平台、引物设计及区域选择不同测序平台、针对细菌、真菌不同微生物实验设计 1.2.测序量及采样建议 1.3.分析流程图 1.4.结果解析 2.DSS(directshotgunsequencing)法 |
R语言绘图(ggplot2) | R语言基本介绍 1、R语言基本运算、向量函数 2、R语言数据读入以及导出 3、ggplot2基本绘图(条形图、散点图、折线图等) 4、部分生存分析实例讲 |
变异位点分析软件GATK上机操作 | 1.基本信息分析:rawdata数据整理及数据质量评估; 2.数据通过GATK,SAMtools等检测SNP和InDel变异信息; 3.将SNP和InDel与dbSNP和千人基因组数据进行比对分析; 4.变异所在基因的功能注释; |
16S分析软件QIIME上机操作 | 一、Linux系统操作简介 1.1Linux简史 1.2Linux与生物信息学 1.3Linux基本命令 1.4Linux基本操作综合实践 二、QIIME上机操作 1.笔记本电脑配置要求建议笔记本内存4G以上,64位操作系统 2.针对16SrDNAampliconsequencing分析 2.1.虚拟机安装:VirtualBox 2.2.16S分析运行环境搭建:QIIMEVirtualMachine 2.3.实例演示及结果展示 数据预处理 OTU聚类 物种注释 OTUtable生成 α多样性分析 序列比对 构建进化树 β多样性分析 3.针对shotgunsequencing分析(只做流程演示讲解) 3.1.序列质量控制:fastqc 3.2.序列拼接 3.3.基因预测及丰度分析 3.4.物种注释 3.5.功能注释 3.6.MetaSPAdes、MEGAN、metAMOS等软件介绍 |
五、主讲专家:
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室胡主任,拥有丰富的科研及工程技术经验,长期从事生物信息领域项目研究,具有资深的技术底蕴和专业背景。
六、关于证书:学员经培训考试合格后可以获得:
1.由北京中科云畅应用技术研究院颁发的生物信息培训班结业证书。
2.注:请学员提供身份证复印件一张。
七、报名办法及费用:
学费3900元(含报名费、培训费、资料费、上机费等相关费用)食宿统一安排,费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训,各单位也可直接报名参加,报名回执表请邮件回复至会务组。
八、联系方式:
联系人:唐喆
移动电话:13331176096 联系电话/传真:010-89368120
报名邮箱:2900331703@qq.com;1320037633@qq.com