邀请函

2018年11月关于举办“精准医学与药物基因组测序应用最新技术与数据分析”系统培训班

2018-10-11 16:46来源:医学教育网T
中医实用技术大健康产业新项目

各有关单位:

近年来,随着我国精准医疗产业迅速发展,精准医疗技术的研究与应用取得了长足的进步。精准医学研究作为科技部国家重点研发计划重点专项,对构建国家大型健康队列和重大疾病专病队列,建立多层次生物医学大数据共享平台,建立大规模疾病预警、诊断、治疗与疗效评价体系等方面具有重要意义,是显著提升人口健康水平、实施健康中国战略过程中不可或缺的一部分。

精准医学的最终目的是实现对于疾病和特定患者的个体化精准治疗,提高疾病的诊治与预防效益,而精准用药正是实现这一目标的重要环节。在医药分开持续推进的过程中,药师转型的速度明显加快,药师群体也希望提升自身业务水平以适应这次改革浪潮。同时,近几年基因检测飞速发展,测序技术的突破也带动了药物基因组学的发展,这为临床提出了更高要求。为进一步推动我国生物信息学方面的发展,提高从业人员的技术水平,由北京中科云畅应用技术研究院举办“精准医学与药物基因组数据分析”高级培训班,并由北京中科润开生物科技有限公司具体承办,具体事宜通知如下:

一、课程特点:

1、系统介绍科研项目如何从大思路着眼进行海量数据挖掘;

2、结合各大项目实践经验,详细介绍多种数据分析软件的使用方法;

3、理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行;

4、精心挑选相应的上机软件,为每位学员提供实际操作的机会;

5、课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答。

二、培训对象:

生命组学科、精准医学和中医药研究机构、临床科研人员,大学、医院等专家学者。大中专院校生物信息、生物计算、生命科学、医学、教研室骨干人员、教学管理人员;科研单位从事医学、生物、生命科学、相关人员;生物、医药、化学及相关企业的领导与技术骨干。

三、时间地点:      2018年11月9日——11月12日   北京

(时间安排:第1天报到,授课3天)

四、培训内容:

章节  内容 
基因组学技术在临床中的应用  1.外显子捕获测序(WES)技术
2.WES筛选疾病致病基因策略
3.基于NGS的肿瘤个体化数据分析
4.临床案例分析
5.生存分析基本概念以及常用分析方法 
基因组学技术在致病基因发现  1.药物基因组学分析
2.临床案例分析
3.应用二代测序技术研究发病机理、开发临检标志物 
宏基因组与精准医疗  1.16SrDNAAMPLICONSEQUENCING法
1.1.测序平台、引物设计及区域选择不同测序平台、针对细菌、真菌不同微生物实验设计
1.2.测序量及采样建议
1.3.分析流程图
1.4.结果解析
2.DSS(directshotgunsequencing)法 
R语言绘图(ggplot2  R语言基本介绍
1、R语言基本运算、向量函数
2、R语言数据读入以及导出
3、ggplot2基本绘图(条形图、散点图、折线图等)
4、部分生存分析实例讲 
变异位点分析软件GATK上机操作  1.基本信息分析:rawdata数据整理及数据质量评估;
2.数据通过GATK,SAMtools等检测SNP和InDel变异信息;
3.将SNP和InDel与dbSNP和千人基因组数据进行比对分析;
4.变异所在基因的功能注释; 
16S分析软件QIIME上机操作  一、Linux系统操作简介
1.1Linux简史
1.2Linux与生物信息学
1.3Linux基本命令
1.4Linux基本操作综合实践
二、QIIME上机操作
1.笔记本电脑配置要求建议笔记本内存4G以上,64位操作系统
2.针对16SrDNAampliconsequencing分析
2.1.虚拟机安装:VirtualBox
2.2.16S分析运行环境搭建:QIIMEVirtualMachine
2.3.实例演示及结果展示
数据预处理
OTU聚类
物种注释
OTUtable生成
α多样性分析
序列比对
构建进化树
β多样性分析
3.针对shotgunsequencing分析(只做流程演示讲解)
3.1.序列质量控制:fastqc
3.2.序列拼接
3.3.基因预测及丰度分析
3.4.物种注释
3.5.功能注释
3.6.MetaSPAdes、MEGAN、metAMOS等软件介绍 

五、主讲专家:

中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室胡主任,拥有丰富的科研及工程技术经验,长期从事生物信息领域项目研究,具有资深的技术底蕴和专业背景。

六、关于证书:学员经培训考试合格后可以获得:

1.由北京中科云畅应用技术研究院颁发的生物信息培训班结业证书。

2.注:请学员提供身份证复印件一张。

七、报名办法及费用:

学费3900元(含报名费、培训费、资料费、上机费等相关费用)食宿统一安排,费用自理。请各有关部门统一组织本地区行政、企事业单位报名参加培训,各单位也可直接报名参加,报名回执表请邮件回复至会务组。

八、联系方式:

联系人:唐喆

移动电话:13331176096       联系电话/传真:010-89368120

报名邮箱:2900331703@qq.com;1320037633@qq.com

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