本次精品班将于11月27日至30日在北京举办,实用微生物组学信息分析精品班报名平台活动家。
为帮助各领域广大科研人员解决从方案设计、数据解读、图表绘制、数据挖掘和文章设计各环节中遇到的问题。北京市计算中心特聘请XX一线项目经验丰富的科研人员精心组织了本次培训课程,为保证听课质量和教学质量,本研讨班采用小班授课方式。课程内容针对性极强、上机实践比重更达到70%,整套课程教学目的明确,从微生物组学实验方案的宏观到细节再到注意事项的讲解,为项目能产出更有效的测序数据打下坚实的基础,上机实践课程贯穿从测序数据下机后质量评估、物种注释到数据分析和结果呈现整个流程。诚邀各领域广大科研工作者和高校教师及研究生报名参加!
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三层会议室
培训时间:2017年11月27日-30日 (报名中) 上午:9:30 - 12:00 下午:1:30 – 5:00
会议日程
第一天
9:30-12:00
微生物组学研究概论及进展
1、微生物组研究的发展历史
2、微生物测序分析技术及实验技术原理
3、研究热点分享
13:30-17:30
经典案例分享和方案设计与文章架构设计
1、微生物组学经典文章回顾,未来微生物组学发展方向
2、已发表各类精品文章的经验总结:包括经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案
3、文章写作经验分享,包括文章架构设计、语言风格、结果呈现等写作技巧
第二天
9:00-12:00
Linux基础操作
1、Linux常用命令使用和上机操作
2、Linux环境下软件安装
16s测序分析结果解读
1、OUT分析
2、物种分类与丰度分析
3、Alpha多样性分析
4、Beta多样性分析
5、显著性差异分析
13:30-17:30
16s数据分析
(上机)
1、质控与数据拼接
2、OTU聚类
3、物种注释
4、统计分析:(1)α多样性分析;(2)β多样性分析;(3)群落结构及丰度分析;(4)进化分析;(5)差异分析(Lefse);(6)功能分析(picrust)。
第三天
9:00-12:00
宏基因组测序分析结果解读
1、物种注释分析
2、差异物种分析
3、差异基因分析
4、功能注释分析
5、MGS分析
13:30-17:30
宏基因组数据分析(上机)
1、质控
2、拼接组装
3、聚类Binning:TETRA; MetaCluster; Phymm等
4、基因注释:FragGeneScan;MetaGeneMark;MetaGeneAnnotator等
5、功能注释:RAMMCAP;Blast等
6、统计分析:(1)物种分析;(2)功能分析;(3)差异分析;(4)比较分析
第四天
9:00-12:00
R的数据处理功能及统计应用
1、R的安装、运行与使用
2、R语法介绍(R基本符号)
3、R数据处理,对R语言中常用的数据结构包括向量,数组,矩阵,列表,数据框等的介绍、使用方法及使用范围
13:30-17:30
R绘图功能在微生物组学信息分析中的应用
1、基础绘图工具(绘图函数、参数、画图面板分割及图形的保存)
2、图形案例实际操作
2.1散点图-点线混合图、并列散点图、坐标对数话
2.2条形图-标准条形图、推积条形图Error Bar形图
2.3饼图
2.4盒形图(箱线图)
2.5频率直方图
2.6热图
有意参会请咨询:
活动家
028-69761252